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国家人口健康科学数据中心
国家人口健康科学数据中心（National Population Health Data Center, NPHDC）是国家科技部和财政部认定20个的国家科学数据中心之一，属于国家科技基础条件平台下的国家科技资源共享服务平台，主管部门是国家卫生健康委，依托中国医学科学院建设。由中国工程院院士、国际医学科学院组织主席，原中国医学科学院 北京协和医学院院校长、中国工程院副院长刘德培院士担任负责人。按照国家《科学数据管理办法》和《国家科技资源共享服务平台管理办法》的要求，承担国家人口健康领域科学数据整合汇交、审核、加工、保存、挖掘、认证和共享服务任务，保障人口健康领域科学数据的长期保存和持续管理。
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中国医学科学院医学实验动物研究所
医学实验动物研究所成立于1980年，是中国医学科学院的专业研究所之一。研究所是从事实验动物学和比较医学科研与教学的专业研究所，是国内唯一的集实验动物和疾病动物模型资源创制、保种和生产供应、比较医学技术研究、及实验动物技术培训于一体的研究单位，是国家级的传染病和新药创制研究的实验动物技术平台的承担单位，是卫生部人类疾病比较医学重点实验室和国家中医药局三级实验室。研究所通过了国家实验室认可及国际AAALAC认证。
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中国医学科学院北京协和医学院输血研究所
中国医学科学院北京协和医学院输血研究所（以下简称输血所）始建于1957年，1965年从中国医学科学院输血及血液学研究所拆分出来，由天津迁到四川成都，成为一个独立研究所。作为我国唯一的国家级输血医学研究机构，主要从事输血医学科学研究、输血相关技术研究，为国家血液安全管理、应急医疗体系建设、输血科学技术发展及全民知识普及等方面提供信息咨询和技术支持，担负着我国输血医学研究与发展的重要使命。
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中国中医科学院中药研究所
中国中医科学院中药研究所始建于1955年，是我国成立最早的一所国家级研究中药的专门机构。自1983年起被确认为世界卫生组织传统医学合作中心。中药研究所经过六十五年的科学研究实践，培养造就了一批从事文献、中药资源及品种鉴定、化学、质量标准、炮制、制剂、药理、毒理和新药研发的科技骨干。全所现有职工500余人，设有中药理论与本草文献研究中心、生药研究中心、中药质量标准研究中心、中药制剂研究中心、中药炮制研究中心、中药药代动力学研究中心、中药药理研究中心、生物力药理学研究中心、中药安全评价中心（GLP）、 中药注射剂安全性研究中心、中药新药研发中心、中药生物技术研究中心、中药数据中心、整合中药学研究中心、雾化吸入制剂研究中心和期刊部，以及挂靠管理单位中国中医科学院中药资源中心、中国中医科学院青蒿素研究中心。
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中国医学科学院放射医学研究所
中国医学科学院放射医学研究所是我国卫生系统最早从事放射医学与核医学研究的专业机构。放射所于1959年6月在北京成立，1969年迁往四川简阳，1984年迁至天津。研究所位于天津市南开区新技术产业园区，与天津大学和南开大学相邻，占地面积1.9万平方米。研究所在六十余年发展和进步历史中为我国国民经济建设、科技发展和国家辐射安全做出了重要的贡献。1997年研究所被卫生部批准为卫生部核事故医学应急中心第一临床部，成为了我国核事故应急临床救治及后备技术研究的重要基地。研究所出色和圆满完成了国内外多起急性核事故医学应急任务，特别是采用研究所自行研制的辐射防护药物直接参与了前苏联切尔诺贝利核电站事故人员的救治工作，为国家争得了荣誉。
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上海市中医老年医学研究所
上海市中医老年医学研究所成立于1990年，是国内唯一一所省级独立建制的中医老年医学研究所，隶属上海中医药大学，与上海中医药大学附属龙华医院实行院所合署，下设老年病临床研究室、老年病实验室、新药研发实验室等部门。目前是中华中医药学会老年病分会副主委单位、世界中医药学会联合会老年医学专业委员会副会长单位、上海市中医药学会老年病分会主委单位。近年主要开展中医药延缓衰老及防治阿尔茨海默病、老年衰弱症、动脉粥样硬化/血管老化、老年肿瘤等老年慢性疾病的临床与基础研究，承担国家自然科学基金、上海市自然科学基金等国家/上海市科研课题20多项，获中华中医药学会科学技术三等奖、上海市科技进步一等奖各1项，国家发明专利授权1项、受理3项，发表SCI 收录论文40多篇，主编/主译《中医名方临床集验》《非编码RNA表观遗传学》等学术专著4部。
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医学生物研究所
研究所建于1958年，集医学科学研究和生物制品研制生产为一体。主要从事医学病毒学、免疫学、分子生物学技术、医学遗传学、分子流行病学及以灵长类动物为主的实验动物及动物实验技术的基础和应用研究，进行疫苗、免疫制品和基因工程产品的规模化生产;是“世界卫生组织肠道病毒参考研究合作中心”;是北京协和医学院(清华大学医学部)硕士和博士学位授予点。研究所具有悠久的生物制品生产历史，是我国最大的口服脊髓灰质炎减毒活疫苗研制生产基地。疫苗自年代上市至今，已生产并向全国儿童计划免疫累计提供多亿人份。疫苗的使用使我国脊髓灰质炎的发病率自六十年代末的万下降到年后不再有野毒株引起的病例报告，为中国控制和消灭脊髓灰质炎并保持无脊灰状态做出了巨大贡献。研究所还是我国最大的系列化甲型肝炎疫苗研制生产基地。疫苗自年上市以来，已生产并向全国累计提供亿多人份，为中国控制甲型肝炎的爆发流行、降低发病率发挥了重要作用。
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中国医学科学院北京协和医学院医药生物技术研究所
中国医学科学院北京协和医学院医药生物技术研究所（以下简称药生所）创建于1958年，原名抗菌素研究所，前身可追溯到北洋政府时期的北平天坛中央防疫处，是中国抗生素的发源地和摇篮。自成功研发第一支青霉素以来，迄今已完成了临床各大类几十种抗生素的研发，占国产抗生素50%以上，为我国抗生素的研发、人才培养及产业发展起到了奠基作用，在国家感染性疾病控制中做出了突出贡献。药生所的重点领域与特色专业是抗感染药物、微生物药物与生物技术药物研究，在国内一直保持相关学科和领域的研究优势。建所六十多年来，已获新药证书及药品注册批件70余件，国内外授权专利300余项，100多项科技成果获国家及省部级奖励，累计发表科研论文3000余篇。药生所已建成了综合的新药研究体系，并在抗感染及微生物药物领域形成优势地位。在新冠肺炎疫情防控科技攻关中，药生所充分发挥自身特色优势，通过合作研究将自主创新药物可利霉素等三个品种推向临床研究，并在基础研究中取得了重要发现，为疫情防控提供了强有力的支撑作用。另外，研究所在抗代谢综合征、抗心血管系统疾病及生物技术药物领域的布局也较为完整，在相关的基础研究及新药研发方面均取得了重要进展。
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